Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHDC9Q8NEP7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KLHDC9Q8NEP7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KLHDC9Q8NEP7 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC9Q8NEP7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC9Q8NEP7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC9Q8NEP7 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC9Q8NEP7 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC9Q8NEP7 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC9Q8NEP7 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC9Q8NEP7 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC9Q8NEP7 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC9Q8NEP7 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC9Q8NEP7 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC9Q8NEP7 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC9Q8NEP7 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC9Q8NEP7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC9Q8NEP7 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC9Q8NEP7 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC9Q8NEP7 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC9Q8NEP7 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC9Q8NEP7 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC9Q8NEP7 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC9Q8NEP7 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC9Q8NEP7 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC9Q8NEP7 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC9Q8NEP7 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC9Q8NEP7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC9Q8NEP7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC9Q8NEP7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC9Q8NEP7 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms