Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND90

PNMA1, Paraneoplastic antigen Ma1, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA1Q8ND90 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PNMA1Q8ND90 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PNMA1Q8ND90 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PNMA1Q8ND90 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PNMA1Q8ND90 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PNMA1Q8ND90 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PNMA1Q8ND90 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PNMA1Q8ND90 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms