Protein–RNA interactions for Protein: Q8N271

PROM2, Prominin-2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM2Q8N271 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PROM2Q8N271 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PROM2Q8N271 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PROM2Q8N271 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PROM2Q8N271 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PROM2Q8N271 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PROM2Q8N271 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PROM2Q8N271 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PROM2Q8N271 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PROM2Q8N271 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PROM2Q8N271 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PROM2Q8N271 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PROM2Q8N271 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PROM2Q8N271 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PROM2Q8N271 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PROM2Q8N271 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PROM2Q8N271 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PROM2Q8N271 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PROM2Q8N271 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PROM2Q8N271 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PROM2Q8N271 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PROM2Q8N271 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PROM2Q8N271 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PROM2Q8N271 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PROM2Q8N271 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PROM2Q8N271 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PROM2Q8N271 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PROM2Q8N271 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PROM2Q8N271 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PROM2Q8N271 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PROM2Q8N271 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PROM2Q8N271 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PROM2Q8N271 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PROM2Q8N271 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PROM2Q8N271 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PROM2Q8N271 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PROM2Q8N271 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PROM2Q8N271 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PROM2Q8N271 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PROM2Q8N271 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PROM2Q8N271 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PROM2Q8N271 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PROM2Q8N271 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PROM2Q8N271 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PROM2Q8N271 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PROM2Q8N271 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PROM2Q8N271 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PROM2Q8N271 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PROM2Q8N271 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PROM2Q8N271 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PROM2Q8N271 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PROM2Q8N271 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PROM2Q8N271 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PROM2Q8N271 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PROM2Q8N271 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PROM2Q8N271 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PROM2Q8N271 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PROM2Q8N271 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PROM2Q8N271 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PROM2Q8N271 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PROM2Q8N271 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PROM2Q8N271 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PROM2Q8N271 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PROM2Q8N271 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PROM2Q8N271 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PROM2Q8N271 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PROM2Q8N271 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PROM2Q8N271 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PROM2Q8N271 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PROM2Q8N271 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PROM2Q8N271 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PROM2Q8N271 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PROM2Q8N271 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PROM2Q8N271 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PROM2Q8N271 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PROM2Q8N271 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PROM2Q8N271 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PROM2Q8N271 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PROM2Q8N271 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PROM2Q8N271 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PROM2Q8N271 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PROM2Q8N271 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PROM2Q8N271 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PROM2Q8N271 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PROM2Q8N271 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PROM2Q8N271 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PROM2Q8N271 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PROM2Q8N271 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PROM2Q8N271 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PROM2Q8N271 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PROM2Q8N271 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PROM2Q8N271 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PROM2Q8N271 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PROM2Q8N271 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PROM2Q8N271 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PROM2Q8N271 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PROM2Q8N271 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PROM2Q8N271 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PROM2Q8N271 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PROM2Q8N271 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms