Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1W1

ARHGEF28, Rho guanine nucleotide exchange factor 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF28Q8N1W1 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARHGEF28Q8N1W1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARHGEF28Q8N1W1 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARHGEF28Q8N1W1 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARHGEF28Q8N1W1 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARHGEF28Q8N1W1 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARHGEF28Q8N1W1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARHGEF28Q8N1W1 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARHGEF28Q8N1W1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARHGEF28Q8N1W1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARHGEF28Q8N1W1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARHGEF28Q8N1W1 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARHGEF28Q8N1W1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARHGEF28Q8N1W1 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARHGEF28Q8N1W1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARHGEF28Q8N1W1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARHGEF28Q8N1W1 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARHGEF28Q8N1W1 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARHGEF28Q8N1W1 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARHGEF28Q8N1W1 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARHGEF28Q8N1W1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARHGEF28Q8N1W1 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARHGEF28Q8N1W1 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARHGEF28Q8N1W1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARHGEF28Q8N1W1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGEF28Q8N1W1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGEF28Q8N1W1 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGEF28Q8N1W1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGEF28Q8N1W1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGEF28Q8N1W1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGEF28Q8N1W1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGEF28Q8N1W1 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGEF28Q8N1W1 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGEF28Q8N1W1 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGEF28Q8N1W1 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGEF28Q8N1W1 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGEF28Q8N1W1 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGEF28Q8N1W1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGEF28Q8N1W1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGEF28Q8N1W1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGEF28Q8N1W1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
ARHGEF28Q8N1W1 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGEF28Q8N1W1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGEF28Q8N1W1 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGEF28Q8N1W1 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGEF28Q8N1W1 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGEF28Q8N1W1 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGEF28Q8N1W1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGEF28Q8N1W1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGEF28Q8N1W1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGEF28Q8N1W1 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGEF28Q8N1W1 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGEF28Q8N1W1 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGEF28Q8N1W1 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGEF28Q8N1W1 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGEF28Q8N1W1 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGEF28Q8N1W1 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGEF28Q8N1W1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGEF28Q8N1W1 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGEF28Q8N1W1 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGEF28Q8N1W1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGEF28Q8N1W1 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGEF28Q8N1W1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGEF28Q8N1W1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGEF28Q8N1W1 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGEF28Q8N1W1 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGEF28Q8N1W1 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGEF28Q8N1W1 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGEF28Q8N1W1 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGEF28Q8N1W1 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGEF28Q8N1W1 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGEF28Q8N1W1 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGEF28Q8N1W1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGEF28Q8N1W1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGEF28Q8N1W1 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGEF28Q8N1W1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGEF28Q8N1W1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGEF28Q8N1W1 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGEF28Q8N1W1 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGEF28Q8N1W1 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGEF28Q8N1W1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGEF28Q8N1W1 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGEF28Q8N1W1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGEF28Q8N1W1 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGEF28Q8N1W1 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGEF28Q8N1W1 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGEF28Q8N1W1 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGEF28Q8N1W1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGEF28Q8N1W1 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARHGEF28Q8N1W1 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARHGEF28Q8N1W1 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARHGEF28Q8N1W1 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARHGEF28Q8N1W1 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARHGEF28Q8N1W1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARHGEF28Q8N1W1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARHGEF28Q8N1W1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARHGEF28Q8N1W1 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARHGEF28Q8N1W1 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARHGEF28Q8N1W1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARHGEF28Q8N1W1 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
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