Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0U6

LINC00518, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00518, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00518Q8N0U6 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms