Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLF2Q8IX21 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms