Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX29P2Q8IUI4 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX29P2Q8IUI4 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX29P2Q8IUI4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX29P2Q8IUI4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX29P2Q8IUI4 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX29P2Q8IUI4 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX29P2Q8IUI4 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX29P2Q8IUI4 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX29P2Q8IUI4 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX29P2Q8IUI4 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX29P2Q8IUI4 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX29P2Q8IUI4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX29P2Q8IUI4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX29P2Q8IUI4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX29P2Q8IUI4 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX29P2Q8IUI4 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX29P2Q8IUI4 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX29P2Q8IUI4 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX29P2Q8IUI4 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX29P2Q8IUI4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX29P2Q8IUI4 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX29P2Q8IUI4 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX29P2Q8IUI4 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX29P2Q8IUI4 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX29P2Q8IUI4 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX29P2Q8IUI4 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX29P2Q8IUI4 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX29P2Q8IUI4 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX29P2Q8IUI4 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX29P2Q8IUI4 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX29P2Q8IUI4 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX29P2Q8IUI4 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX29P2Q8IUI4 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX29P2Q8IUI4 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX29P2Q8IUI4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX29P2Q8IUI4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX29P2Q8IUI4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX29P2Q8IUI4 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX29P2Q8IUI4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX29P2Q8IUI4 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX29P2Q8IUI4 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX29P2Q8IUI4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX29P2Q8IUI4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX29P2Q8IUI4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX29P2Q8IUI4 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX29P2Q8IUI4 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX29P2Q8IUI4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX29P2Q8IUI4 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX29P2Q8IUI4 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX29P2Q8IUI4 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX29P2Q8IUI4 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX29P2Q8IUI4 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX29P2Q8IUI4 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX29P2Q8IUI4 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX29P2Q8IUI4 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX29P2Q8IUI4 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX29P2Q8IUI4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX29P2Q8IUI4 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX29P2Q8IUI4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX29P2Q8IUI4 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX29P2Q8IUI4 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX29P2Q8IUI4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX29P2Q8IUI4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX29P2Q8IUI4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX29P2Q8IUI4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX29P2Q8IUI4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX29P2Q8IUI4 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX29P2Q8IUI4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX29P2Q8IUI4 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX29P2Q8IUI4 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX29P2Q8IUI4 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX29P2Q8IUI4 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX29P2Q8IUI4 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX29P2Q8IUI4 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX29P2Q8IUI4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX29P2Q8IUI4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX29P2Q8IUI4 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX29P2Q8IUI4 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNX29P2Q8IUI4 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNX29P2Q8IUI4 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SNX29P2Q8IUI4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNX29P2Q8IUI4 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNX29P2Q8IUI4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNX29P2Q8IUI4 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNX29P2Q8IUI4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNX29P2Q8IUI4 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNX29P2Q8IUI4 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms