Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC84Q86UT8 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms