Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE8

NPM2, Nucleoplasmin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM2Q86SE8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NPM2Q86SE8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NPM2Q86SE8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NPM2Q86SE8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NPM2Q86SE8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NPM2Q86SE8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NPM2Q86SE8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NPM2Q86SE8 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NPM2Q86SE8 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NPM2Q86SE8 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NPM2Q86SE8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NPM2Q86SE8 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NPM2Q86SE8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NPM2Q86SE8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NPM2Q86SE8 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NPM2Q86SE8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NPM2Q86SE8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NPM2Q86SE8 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NPM2Q86SE8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NPM2Q86SE8 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NPM2Q86SE8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NPM2Q86SE8 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NPM2Q86SE8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NPM2Q86SE8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NPM2Q86SE8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NPM2Q86SE8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NPM2Q86SE8 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NPM2Q86SE8 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NPM2Q86SE8 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NPM2Q86SE8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NPM2Q86SE8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NPM2Q86SE8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NPM2Q86SE8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NPM2Q86SE8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NPM2Q86SE8 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NPM2Q86SE8 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NPM2Q86SE8 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NPM2Q86SE8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NPM2Q86SE8 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NPM2Q86SE8 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NPM2Q86SE8 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NPM2Q86SE8 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NPM2Q86SE8 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NPM2Q86SE8 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NPM2Q86SE8 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NPM2Q86SE8 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NPM2Q86SE8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NPM2Q86SE8 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NPM2Q86SE8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NPM2Q86SE8 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NPM2Q86SE8 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms