Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B0

SMIM15, Small integral membrane protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM15Q7Z3B0 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM15Q7Z3B0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM15Q7Z3B0 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM15Q7Z3B0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM15Q7Z3B0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM15Q7Z3B0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM15Q7Z3B0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM15Q7Z3B0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM15Q7Z3B0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM15Q7Z3B0 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms