Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5L3

GDPD3, Lysophospholipase D GDPD3, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD3Q7L5L3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms