Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC31.44■■■□□ 2.62
HECW1Q76N89 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
HECW1Q76N89 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
HECW1Q76N89 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
HECW1Q76N89 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
HECW1Q76N89 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
HECW1Q76N89 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
HECW1Q76N89 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
HECW1Q76N89 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
HECW1Q76N89 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
HECW1Q76N89 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
HECW1Q76N89 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
HECW1Q76N89 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
HECW1Q76N89 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
HECW1Q76N89 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC31.43■■■□□ 2.62
HECW1Q76N89 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
HECW1Q76N89 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
HECW1Q76N89 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
HECW1Q76N89 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
HECW1Q76N89 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
HECW1Q76N89 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
HECW1Q76N89 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
HECW1Q76N89 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
HECW1Q76N89 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
HECW1Q76N89 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
HECW1Q76N89 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
HECW1Q76N89 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
HECW1Q76N89 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
HECW1Q76N89 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
HECW1Q76N89 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
HECW1Q76N89 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
HECW1Q76N89 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
HECW1Q76N89 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
HECW1Q76N89 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
HECW1Q76N89 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
HECW1Q76N89 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
HECW1Q76N89 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
HECW1Q76N89 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
HECW1Q76N89 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
HECW1Q76N89 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
HECW1Q76N89 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
HECW1Q76N89 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
HECW1Q76N89 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
HECW1Q76N89 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
HECW1Q76N89 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
HECW1Q76N89 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
HECW1Q76N89 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
HECW1Q76N89 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
HECW1Q76N89 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
HECW1Q76N89 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
HECW1Q76N89 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
HECW1Q76N89 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
HECW1Q76N89 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
HECW1Q76N89 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
HECW1Q76N89 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
HECW1Q76N89 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
HECW1Q76N89 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
HECW1Q76N89 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
HECW1Q76N89 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
HECW1Q76N89 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
HECW1Q76N89 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
HECW1Q76N89 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
HECW1Q76N89 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
HECW1Q76N89 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
HECW1Q76N89 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
HECW1Q76N89 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
HECW1Q76N89 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
HECW1Q76N89 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
HECW1Q76N89 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
HECW1Q76N89 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
HECW1Q76N89 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
HECW1Q76N89 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
HECW1Q76N89 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
HECW1Q76N89 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
HECW1Q76N89 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
HECW1Q76N89 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
HECW1Q76N89 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
HECW1Q76N89 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
HECW1Q76N89 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
HECW1Q76N89 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
HECW1Q76N89 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC31.38■■■□□ 2.61
HECW1Q76N89 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC31.38■■■□□ 2.61
HECW1Q76N89 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC31.38■■■□□ 2.61
HECW1Q76N89 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
HECW1Q76N89 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
HECW1Q76N89 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
HECW1Q76N89 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
HECW1Q76N89 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
HECW1Q76N89 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
HECW1Q76N89 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
HECW1Q76N89 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
HECW1Q76N89 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
HECW1Q76N89 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
HECW1Q76N89 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
HECW1Q76N89 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
HECW1Q76N89 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
HECW1Q76N89 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
HECW1Q76N89 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
HECW1Q76N89 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
HECW1Q76N89 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms