Protein–RNA interactions for Protein: Q76I76

SSH2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH2Q76I76 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
SSH2Q76I76 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
SSH2Q76I76 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
SSH2Q76I76 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
SSH2Q76I76 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SSH2Q76I76 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SSH2Q76I76 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SSH2Q76I76 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SSH2Q76I76 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SSH2Q76I76 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SSH2Q76I76 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SSH2Q76I76 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SSH2Q76I76 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SSH2Q76I76 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SSH2Q76I76 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SSH2Q76I76 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SSH2Q76I76 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SSH2Q76I76 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SSH2Q76I76 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SSH2Q76I76 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SSH2Q76I76 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SSH2Q76I76 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms