Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV60

LINC00173, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00173, humanhuman

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00173Q6ZV60 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00173Q6ZV60 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms