Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXD4L3Q6VB84 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms