Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMBR1LQ6UX01 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMBR1LQ6UX01 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LMBR1LQ6UX01 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LMBR1LQ6UX01 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMBR1LQ6UX01 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMBR1LQ6UX01 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms