Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU7

CASC1, Protein CASC1, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC1Q6TDU7 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASC1Q6TDU7 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASC1Q6TDU7 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASC1Q6TDU7 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASC1Q6TDU7 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASC1Q6TDU7 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASC1Q6TDU7 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASC1Q6TDU7 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASC1Q6TDU7 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASC1Q6TDU7 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASC1Q6TDU7 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASC1Q6TDU7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASC1Q6TDU7 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASC1Q6TDU7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASC1Q6TDU7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASC1Q6TDU7 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASC1Q6TDU7 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASC1Q6TDU7 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASC1Q6TDU7 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASC1Q6TDU7 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASC1Q6TDU7 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASC1Q6TDU7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASC1Q6TDU7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASC1Q6TDU7 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASC1Q6TDU7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASC1Q6TDU7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASC1Q6TDU7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASC1Q6TDU7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASC1Q6TDU7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASC1Q6TDU7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CASC1Q6TDU7 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASC1Q6TDU7 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASC1Q6TDU7 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASC1Q6TDU7 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASC1Q6TDU7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASC1Q6TDU7 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASC1Q6TDU7 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASC1Q6TDU7 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASC1Q6TDU7 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASC1Q6TDU7 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASC1Q6TDU7 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASC1Q6TDU7 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASC1Q6TDU7 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASC1Q6TDU7 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASC1Q6TDU7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASC1Q6TDU7 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASC1Q6TDU7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASC1Q6TDU7 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASC1Q6TDU7 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASC1Q6TDU7 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASC1Q6TDU7 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASC1Q6TDU7 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASC1Q6TDU7 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASC1Q6TDU7 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASC1Q6TDU7 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CASC1Q6TDU7 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASC1Q6TDU7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASC1Q6TDU7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASC1Q6TDU7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASC1Q6TDU7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASC1Q6TDU7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASC1Q6TDU7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CASC1Q6TDU7 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASC1Q6TDU7 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASC1Q6TDU7 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASC1Q6TDU7 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASC1Q6TDU7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASC1Q6TDU7 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASC1Q6TDU7 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASC1Q6TDU7 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASC1Q6TDU7 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASC1Q6TDU7 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASC1Q6TDU7 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASC1Q6TDU7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASC1Q6TDU7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASC1Q6TDU7 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASC1Q6TDU7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASC1Q6TDU7 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASC1Q6TDU7 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASC1Q6TDU7 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASC1Q6TDU7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASC1Q6TDU7 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASC1Q6TDU7 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASC1Q6TDU7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASC1Q6TDU7 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.51
CASC1Q6TDU7 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASC1Q6TDU7 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASC1Q6TDU7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASC1Q6TDU7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASC1Q6TDU7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASC1Q6TDU7 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASC1Q6TDU7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASC1Q6TDU7 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASC1Q6TDU7 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASC1Q6TDU7 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASC1Q6TDU7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASC1Q6TDU7 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASC1Q6TDU7 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASC1Q6TDU7 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASC1Q6TDU7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms