Protein–RNA interactions for Protein: Q6PKG0

LARP1, La-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1Q6PKG0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LARP1Q6PKG0 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms