Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF544Q6NX49 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF544Q6NX49 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF544Q6NX49 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF544Q6NX49 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF544Q6NX49 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF544Q6NX49 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF544Q6NX49 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF544Q6NX49 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF544Q6NX49 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF544Q6NX49 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF544Q6NX49 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF544Q6NX49 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF544Q6NX49 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF544Q6NX49 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF544Q6NX49 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF544Q6NX49 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF544Q6NX49 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF544Q6NX49 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF544Q6NX49 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF544Q6NX49 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF544Q6NX49 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF544Q6NX49 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF544Q6NX49 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF544Q6NX49 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF544Q6NX49 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF544Q6NX49 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF544Q6NX49 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF544Q6NX49 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF544Q6NX49 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF544Q6NX49 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF544Q6NX49 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF544Q6NX49 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF544Q6NX49 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF544Q6NX49 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF544Q6NX49 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF544Q6NX49 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF544Q6NX49 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF544Q6NX49 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF544Q6NX49 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF544Q6NX49 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF544Q6NX49 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF544Q6NX49 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF544Q6NX49 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF544Q6NX49 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF544Q6NX49 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF544Q6NX49 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF544Q6NX49 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF544Q6NX49 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF544Q6NX49 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF544Q6NX49 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF544Q6NX49 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF544Q6NX49 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF544Q6NX49 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF544Q6NX49 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF544Q6NX49 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF544Q6NX49 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF544Q6NX49 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms