Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVH7

SWSAP1, ATPase SWSAP1, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWSAP1Q6NVH7 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SWSAP1Q6NVH7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms