Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSX1

CCDC70, Coiled-coil domain-containing protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC70Q6NSX1 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms