Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SDE2Q6IQ49 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SDE2Q6IQ49 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SDE2Q6IQ49 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SDE2Q6IQ49 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SDE2Q6IQ49 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SDE2Q6IQ49 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SDE2Q6IQ49 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SDE2Q6IQ49 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SDE2Q6IQ49 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SDE2Q6IQ49 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SDE2Q6IQ49 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SDE2Q6IQ49 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SDE2Q6IQ49 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SDE2Q6IQ49 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SDE2Q6IQ49 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SDE2Q6IQ49 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SDE2Q6IQ49 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SDE2Q6IQ49 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SDE2Q6IQ49 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SDE2Q6IQ49 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SDE2Q6IQ49 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SDE2Q6IQ49 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SDE2Q6IQ49 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SDE2Q6IQ49 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SDE2Q6IQ49 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SDE2Q6IQ49 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SDE2Q6IQ49 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SDE2Q6IQ49 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SDE2Q6IQ49 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SDE2Q6IQ49 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SDE2Q6IQ49 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SDE2Q6IQ49 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SDE2Q6IQ49 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SDE2Q6IQ49 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SDE2Q6IQ49 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SDE2Q6IQ49 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SDE2Q6IQ49 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SDE2Q6IQ49 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SDE2Q6IQ49 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SDE2Q6IQ49 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SDE2Q6IQ49 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SDE2Q6IQ49 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SDE2Q6IQ49 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SDE2Q6IQ49 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SDE2Q6IQ49 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SDE2Q6IQ49 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SDE2Q6IQ49 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SDE2Q6IQ49 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SDE2Q6IQ49 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SDE2Q6IQ49 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SDE2Q6IQ49 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SDE2Q6IQ49 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SDE2Q6IQ49 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SDE2Q6IQ49 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SDE2Q6IQ49 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SDE2Q6IQ49 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SDE2Q6IQ49 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SDE2Q6IQ49 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SDE2Q6IQ49 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SDE2Q6IQ49 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SDE2Q6IQ49 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SDE2Q6IQ49 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SDE2Q6IQ49 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
SDE2Q6IQ49 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SDE2Q6IQ49 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SDE2Q6IQ49 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SDE2Q6IQ49 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms