Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW22

AGAP6, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP6Q5VW22 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AGAP6Q5VW22 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AGAP6Q5VW22 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms