Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms