Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTH9

WDR78, WD repeat-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR78Q5VTH9 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
WDR78Q5VTH9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms