Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGJ6

HDGFL1, Hepatoma-derived growth factor-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL1Q5TGJ6 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
HDGFL1Q5TGJ6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms