Protein–RNA interactions for Protein: Q5T8R8

C9orf66, Uncharacterized protein C9orf66, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf66Q5T8R8 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf66Q5T8R8 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms