Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ08

SPANXN4, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N4, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN4Q5MJ08 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPANXN4Q5MJ08 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SPANXN4Q5MJ08 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SPANXN4Q5MJ08 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms