Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVL4

EFHC1, EF-hand domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC1Q5JVL4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EFHC1Q5JVL4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EFHC1Q5JVL4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EFHC1Q5JVL4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EFHC1Q5JVL4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EFHC1Q5JVL4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EFHC1Q5JVL4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EFHC1Q5JVL4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EFHC1Q5JVL4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms