Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC178Q5BJE1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms