Protein–RNA interactions for Protein: Q52LW3

ARHGAP29, Rho GTPase-activating protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP29Q52LW3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms