Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C4orf46Q504U0 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms