Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00303Q3SY05 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms