Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI81

KRTAP27-1, Keratin-associated protein 27-1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP27-1Q3LI81 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
KRTAP27-1Q3LI81 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KRTAP27-1Q3LI81 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KRTAP27-1Q3LI81 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KRTAP27-1Q3LI81 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KRTAP27-1Q3LI81 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms