Protein–RNA interactions for Protein: Q2VIQ3

KIF4B, Chromosome-associated kinesin KIF4B, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4BQ2VIQ3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIF4BQ2VIQ3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIF4BQ2VIQ3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIF4BQ2VIQ3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIF4BQ2VIQ3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIF4BQ2VIQ3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIF4BQ2VIQ3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIF4BQ2VIQ3 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIF4BQ2VIQ3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIF4BQ2VIQ3 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIF4BQ2VIQ3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIF4BQ2VIQ3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIF4BQ2VIQ3 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIF4BQ2VIQ3 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KIF4BQ2VIQ3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIF4BQ2VIQ3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIF4BQ2VIQ3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIF4BQ2VIQ3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIF4BQ2VIQ3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIF4BQ2VIQ3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KIF4BQ2VIQ3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIF4BQ2VIQ3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KIF4BQ2VIQ3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KIF4BQ2VIQ3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KIF4BQ2VIQ3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KIF4BQ2VIQ3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KIF4BQ2VIQ3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KIF4BQ2VIQ3 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KIF4BQ2VIQ3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KIF4BQ2VIQ3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KIF4BQ2VIQ3 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KIF4BQ2VIQ3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KIF4BQ2VIQ3 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KIF4BQ2VIQ3 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KIF4BQ2VIQ3 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KIF4BQ2VIQ3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KIF4BQ2VIQ3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KIF4BQ2VIQ3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KIF4BQ2VIQ3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KIF4BQ2VIQ3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KIF4BQ2VIQ3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KIF4BQ2VIQ3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KIF4BQ2VIQ3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KIF4BQ2VIQ3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KIF4BQ2VIQ3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KIF4BQ2VIQ3 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KIF4BQ2VIQ3 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KIF4BQ2VIQ3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KIF4BQ2VIQ3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KIF4BQ2VIQ3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KIF4BQ2VIQ3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KIF4BQ2VIQ3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KIF4BQ2VIQ3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KIF4BQ2VIQ3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KIF4BQ2VIQ3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KIF4BQ2VIQ3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KIF4BQ2VIQ3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KIF4BQ2VIQ3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KIF4BQ2VIQ3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KIF4BQ2VIQ3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KIF4BQ2VIQ3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KIF4BQ2VIQ3 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KIF4BQ2VIQ3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KIF4BQ2VIQ3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KIF4BQ2VIQ3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KIF4BQ2VIQ3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KIF4BQ2VIQ3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms