Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL40Q2TBA0 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms