Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2W7

C17orf58, UPF0450 protein C17orf58, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf58Q2M2W7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms