Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL24A1Q17RW2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL24A1Q17RW2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL24A1Q17RW2 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL24A1Q17RW2 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL24A1Q17RW2 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL24A1Q17RW2 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL24A1Q17RW2 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL24A1Q17RW2 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
COL24A1Q17RW2 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL24A1Q17RW2 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL24A1Q17RW2 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL24A1Q17RW2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL24A1Q17RW2 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL24A1Q17RW2 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL24A1Q17RW2 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL24A1Q17RW2 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL24A1Q17RW2 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL24A1Q17RW2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL24A1Q17RW2 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL24A1Q17RW2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL24A1Q17RW2 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
COL24A1Q17RW2 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.68
COL24A1Q17RW2 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
COL24A1Q17RW2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL24A1Q17RW2 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
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