Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DUSP6Q16828 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DUSP6Q16828 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DUSP6Q16828 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DUSP6Q16828 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DUSP6Q16828 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP6Q16828 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP6Q16828 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP6Q16828 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP6Q16828 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP6Q16828 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP6Q16828 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP6Q16828 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP6Q16828 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP6Q16828 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP6Q16828 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP6Q16828 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP6Q16828 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP6Q16828 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP6Q16828 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP6Q16828 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP6Q16828 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP6Q16828 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP6Q16828 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP6Q16828 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP6Q16828 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP6Q16828 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP6Q16828 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP6Q16828 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DUSP6Q16828 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DUSP6Q16828 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DUSP6Q16828 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
DUSP6Q16828 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DUSP6Q16828 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
DUSP6Q16828 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUSP6Q16828 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUSP6Q16828 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUSP6Q16828 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUSP6Q16828 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUSP6Q16828 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUSP6Q16828 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUSP6Q16828 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUSP6Q16828 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUSP6Q16828 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUSP6Q16828 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUSP6Q16828 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUSP6Q16828 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUSP6Q16828 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUSP6Q16828 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUSP6Q16828 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUSP6Q16828 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP6Q16828 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP6Q16828 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP6Q16828 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP6Q16828 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP6Q16828 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP6Q16828 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP6Q16828 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP6Q16828 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP6Q16828 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP6Q16828 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP6Q16828 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP6Q16828 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP6Q16828 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP6Q16828 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP6Q16828 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP6Q16828 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP6Q16828 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP6Q16828 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP6Q16828 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP6Q16828 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP6Q16828 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP6Q16828 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP6Q16828 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP6Q16828 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP6Q16828 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP6Q16828 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP6Q16828 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP6Q16828 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP6Q16828 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP6Q16828 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP6Q16828 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP6Q16828 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP6Q16828 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP6Q16828 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP6Q16828 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP6Q16828 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP6Q16828 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP6Q16828 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP6Q16828 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUSP6Q16828 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP6Q16828 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP6Q16828 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP6Q16828 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP6Q16828 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP6Q16828 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP6Q16828 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP6Q16828 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP6Q16828 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUSP6Q16828 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms