Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PTPROQ16827 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPROQ16827 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
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