Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNAPC1Q16533 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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