Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
GRIK5Q16478 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIK5Q16478 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
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