Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

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Length 657 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRRQ15256 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
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PTPRRQ15256 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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