Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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