Protein–RNA interactions for Protein: Q14973

SLC10A1, Sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A1Q14973 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC10A1Q14973 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC10A1Q14973 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC10A1Q14973 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC10A1Q14973 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC10A1Q14973 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC10A1Q14973 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC10A1Q14973 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC10A1Q14973 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC10A1Q14973 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC10A1Q14973 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC10A1Q14973 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC10A1Q14973 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC10A1Q14973 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC10A1Q14973 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC10A1Q14973 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC10A1Q14973 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC10A1Q14973 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC10A1Q14973 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC10A1Q14973 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC10A1Q14973 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC10A1Q14973 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC10A1Q14973 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC10A1Q14973 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC10A1Q14973 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC10A1Q14973 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC10A1Q14973 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC10A1Q14973 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC10A1Q14973 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC10A1Q14973 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC10A1Q14973 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC10A1Q14973 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC10A1Q14973 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC10A1Q14973 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC10A1Q14973 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC10A1Q14973 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC10A1Q14973 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC10A1Q14973 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC10A1Q14973 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC10A1Q14973 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC10A1Q14973 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC10A1Q14973 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC10A1Q14973 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC10A1Q14973 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SLC10A1Q14973 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC10A1Q14973 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC10A1Q14973 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC10A1Q14973 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC10A1Q14973 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC10A1Q14973 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC10A1Q14973 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC10A1Q14973 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC10A1Q14973 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC10A1Q14973 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC10A1Q14973 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC10A1Q14973 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC10A1Q14973 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC10A1Q14973 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC10A1Q14973 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC10A1Q14973 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC10A1Q14973 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC10A1Q14973 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC10A1Q14973 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC10A1Q14973 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC10A1Q14973 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC10A1Q14973 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC10A1Q14973 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC10A1Q14973 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC10A1Q14973 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC10A1Q14973 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC10A1Q14973 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC10A1Q14973 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC10A1Q14973 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC10A1Q14973 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC10A1Q14973 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC10A1Q14973 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC10A1Q14973 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC10A1Q14973 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC10A1Q14973 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC10A1Q14973 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC10A1Q14973 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC10A1Q14973 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC10A1Q14973 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC10A1Q14973 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC10A1Q14973 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC10A1Q14973 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC10A1Q14973 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC10A1Q14973 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC10A1Q14973 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC10A1Q14973 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC10A1Q14973 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC10A1Q14973 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC10A1Q14973 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC10A1Q14973 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC10A1Q14973 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC10A1Q14973 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC10A1Q14973 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC10A1Q14973 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC10A1Q14973 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC10A1Q14973 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms