Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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GPNMBQ14956 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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GPNMBQ14956 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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GPNMBQ14956 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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