Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFIXQ14938 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
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