Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
RFTN1Q14699 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RFTN1Q14699 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RFTN1Q14699 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RFTN1Q14699 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RFTN1Q14699 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RFTN1Q14699 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RFTN1Q14699 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RFTN1Q14699 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RFTN1Q14699 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RFTN1Q14699 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RFTN1Q14699 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RFTN1Q14699 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RFTN1Q14699 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RFTN1Q14699 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RFTN1Q14699 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RFTN1Q14699 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RFTN1Q14699 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RFTN1Q14699 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RFTN1Q14699 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RFTN1Q14699 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RFTN1Q14699 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RFTN1Q14699 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RFTN1Q14699 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RFTN1Q14699 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RFTN1Q14699 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RFTN1Q14699 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RFTN1Q14699 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RFTN1Q14699 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RFTN1Q14699 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RFTN1Q14699 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RFTN1Q14699 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RFTN1Q14699 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RFTN1Q14699 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RFTN1Q14699 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RFTN1Q14699 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RFTN1Q14699 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RFTN1Q14699 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RFTN1Q14699 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RFTN1Q14699 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RFTN1Q14699 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RFTN1Q14699 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms