Protein–RNA interactions for Protein: Q14515

SPARCL1, SPARC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPARCL1Q14515 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SPARCL1Q14515 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SPARCL1Q14515 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SPARCL1Q14515 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SPARCL1Q14515 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SPARCL1Q14515 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SPARCL1Q14515 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SPARCL1Q14515 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SPARCL1Q14515 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SPARCL1Q14515 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SPARCL1Q14515 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SPARCL1Q14515 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SPARCL1Q14515 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SPARCL1Q14515 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SPARCL1Q14515 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SPARCL1Q14515 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SPARCL1Q14515 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SPARCL1Q14515 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SPARCL1Q14515 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SPARCL1Q14515 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SPARCL1Q14515 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SPARCL1Q14515 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SPARCL1Q14515 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SPARCL1Q14515 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SPARCL1Q14515 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SPARCL1Q14515 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SPARCL1Q14515 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SPARCL1Q14515 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SPARCL1Q14515 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SPARCL1Q14515 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SPARCL1Q14515 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SPARCL1Q14515 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SPARCL1Q14515 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SPARCL1Q14515 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SPARCL1Q14515 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SPARCL1Q14515 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SPARCL1Q14515 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SPARCL1Q14515 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SPARCL1Q14515 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SPARCL1Q14515 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SPARCL1Q14515 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SPARCL1Q14515 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SPARCL1Q14515 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SPARCL1Q14515 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SPARCL1Q14515 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SPARCL1Q14515 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SPARCL1Q14515 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SPARCL1Q14515 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SPARCL1Q14515 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SPARCL1Q14515 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SPARCL1Q14515 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SPARCL1Q14515 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SPARCL1Q14515 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SPARCL1Q14515 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SPARCL1Q14515 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SPARCL1Q14515 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SPARCL1Q14515 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SPARCL1Q14515 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SPARCL1Q14515 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPARCL1Q14515 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPARCL1Q14515 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPARCL1Q14515 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPARCL1Q14515 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPARCL1Q14515 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPARCL1Q14515 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPARCL1Q14515 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPARCL1Q14515 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPARCL1Q14515 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPARCL1Q14515 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPARCL1Q14515 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPARCL1Q14515 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPARCL1Q14515 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPARCL1Q14515 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SPARCL1Q14515 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SPARCL1Q14515 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPARCL1Q14515 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPARCL1Q14515 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPARCL1Q14515 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SPARCL1Q14515 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SPARCL1Q14515 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SPARCL1Q14515 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SPARCL1Q14515 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SPARCL1Q14515 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SPARCL1Q14515 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SPARCL1Q14515 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SPARCL1Q14515 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SPARCL1Q14515 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SPARCL1Q14515 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SPARCL1Q14515 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SPARCL1Q14515 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SPARCL1Q14515 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SPARCL1Q14515 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SPARCL1Q14515 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SPARCL1Q14515 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SPARCL1Q14515 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SPARCL1Q14515 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPARCL1Q14515 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SPARCL1Q14515 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPARCL1Q14515 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPARCL1Q14515 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms