Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBE4AQ14139 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE4AQ14139 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
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